在迷你西游游戏中有一大特色就是神通系统，每个护法都有不同的神通技能，而且最赞的是这些神通技能会根据玩家不同的需求、加点产生不同的变化。
境界
首先，要提升神通技能，必须先提升境界。有些神通技能都需要境界五、境界十才可以解锁。升级境界需要消耗魂值（可通过融魂系统获得，也可通过奖励）和银两，境界升级并不能提升卡牌的属性，只能解锁神通技能和获得神通点。境界最高只可提升至10级。
神通技能
每个角色的神通技能都不相同，有不同的特效；三个神通都可以触发，造就了护法的独特性。
神通点
卡牌即使升满境界了，神通点也不够加满，所以玩家最好看好技能再下手加点。至于如何加点，也将成为未来一个很值得讨论的玩法。
但有一个途径可以获得额外的神通点——同名卡。如果有了一张相同的卡牌，它会被系统自动吃掉，然后你的那位护法的神通点就会自动多出1-2个点。
